1. irányelv: Az Elsődleges Irányelv:

Mivel minden népnek joga van a saját életének olyan módon való leélésére, ahogy azt normális evolúciója megengedi, ezért a Csillagflotta tagjai nem zavarhatják meg más idegen fajok kultúráját és életét. Ebbe a kategóriába tartozik a fejlettebb tudás, katonai erő, vagy technológia átadása, melyeket az adott társadalom nem képes megfelelő módon kézben tartani. A Csillagflotta tagjai nem sérthetik meg az Elsődleges Irányelvet, még akkor sem, ha a saját életüket és/vagy hajójukat kell megmenteniük, kivéve ha az Elsődleges Irányelv egy korábbi megsértése által bekövetkezett következmények felszámolásán dolgoznak. Ez az Irányelv minden, mindenki felett, és a legelső helyen áll.

2. irányelv:

A Csillagflotta tagjai indokolatlanul nem használhatnak erőszakot, sem egyénileg, sem együttesen a Bolygók Egyesült Föderációjának tagjai, diplomatái, képviselői, egyéb más vezetői, vagy azon személyek ellen akik nem tagjai a Bolygók Egyesült Föderációjának.

3. irányelv:

A Föderáció minden tagjának tiszteletben tartása érdekében a Csillagflotta tagjainak figyelembe kell venniük az adott tagbolygó törvényeit. Az ezen törvényeket megsértőket a helyi hatóságoknak joguk van saját törvényeik szerint megbüntetni.

4. irányelv:

Amennyiben egy ismeretlen, intelligens fajjal történik kapcsolatfelvétel és ez a Csillagflotta tagjain kívül álló okokból történik, sem szóval, sem tettel nem infolmálhatják azokat arról, hogy mi található a saját területükön kívül lévő űrben.

5. irányelv:

Vészhelyzet esetén a Föderáció különleges megbízottjai fel vannak hatalmazva arra, hogy mentőcsapatokat rendeljenek ki, amennyiben a körülmények a Föderáció polgárai számára ártalmasak lehetnek. A veszélyhelyzet elmúltáig, az arra felhatalmazott civil személyek időlegesen átvehetik az irányítást a Csillagflotta hajói és/vagy személyzete felett. A Csillagflotta tagjai alá kell, hogy vessék magukat az adott civil személy irányításának.

6. irányelv:

A Föderáció polgárai által vészhelyzetben kért segélyhívás előnyt és elsődleges prioritást élvez a Csillagflotta tagjaitól. Ilyen segélyhívásra a Csillagflotta tagjai kötelesek azonnal válaszolni és felfüggeszteni minden más tevékenységüket.

7. irányelv:

A Csillagflotta egyetlen hajója sem keresheti fel semmilyen körülmények között a Talos IV bolygót, legyen szó vészhelyzetről, vagy bármilyen más tényezőről. Ez a irányelv felülbírálja a 6. irányelvot. Ennek a irányelvnak a megsértése halálbüntetést von maga után.

8. irányelv:

Amennyiben a Föderációs űr területén belül hadihajót talál, és az azonosítás során idegen hatalomhoz tartozónak bizonyul, az adott Csillagflotta hajó irányelvnoka köteles felszámolni az idegen hajó jelenlétét. Ha az idegen hajó ellenséges szándékról tesz tanubizonyságot, a Föderáció hajója, a Föderáció tagjainak védelmében erőszakkal is felléphet ellene. Ilyen és ehhez hasonló esetekben a irányelvnoknak legteljesebb diszkrécióval kell eljárnia az ellenséges hajó elleni akció során. Egyúttal kerülnie kell az életek veszélyeztetését.

9. irányelv:

A Csilagflotta-hajók irányelvnokai nem adhatnak politikai menedékjogot egyetlen személynek sem, anélkül, hogy előbb a Föderáció kormányzatának képviselőjével ne tárgyaltak volna.

10. irányelv:

Amennyiben bizonyítást nyer, hogy egy adott személy - legyen az akár Csillagflotta-tiszt, akár civil személy - szándékosan megsértette az Elsődleges Irányelvet, abban az esetben a Föderáció jelen lévő képviselője felmentheti a szolgálatból, és azonnal őrizetbe vetetheti. A Föderáció képviselőjének ilyen, és ehhez hasonló akció végrehajtása közben ügyelnie kell, hogy a további beavatkozás minimális legyen.

11. irányelv:

A kapitányi, vagy annál magasabb ranggal rendelkező személyek fel vannak hatalmazva arra, hogy megállapodást és/vagy szerződést kössenek minden nem-Föderációs bolygóval. Hasonló esetekben a helyettesítő tisztek a Föderáció különleges nagyköveteként tevékenykedhetnek. Ilyen esetekben a Csillagflotta Főirányelvnokság Vezérkari Főnökének, vagy a Csillagflotta Titkárának jóváhagyása szükséges.

12. irányelv:

A Föderáció tisztjei a Föderáció polgárainak megmentése érdekében, különleges vészhelyzet esetén megsérthetik a Semleges Zóna területeit.

13. irányelv:

Kivéve, ha a irányelv másként rendelkezik, a Csillagflotta tagjainak el kell fogadniuk a független bolygórendszerek és kormányok területi integritását, és nem sérthetik meg ezen rendszerek határait.

14. irányelv:

A Csillagflotta tagjai közbenjárhatnak helyi bolygókonfliktusokban, de csak abban az esetben tehetik ezt meg, ha hivatalos civil személytől kapnak erre felkérést és csakis akkor ha a civil személy legalább kormányzói, vagy annál magasabb ranggal rendelkezik.

15. irányelv:

Csillagflotta főtiszt nem utazhat potenciálisan veszélyes területre megfelelő fegyveres kíséret nélkül.

16. irányelv:

A Csillagflotta tagjai technikai, orvosi, vagy tudományos segítséget adhatnak egy addig ismeretlen faj képviselőjének, de csak abban az esetben, ha ezzel nem sértik meg az Elsődleges Irányelvet, vagy a Föderáció, avagy a Csillagflotta biztonsági előírásait.

17. irányelv:

A Csillagflotta-hajók kapitányainak tisztában kell lenniük azzal, hogy legénységi tagok élete szent. Veszélyhelyzetekben a kapitánynak a hajó biztonsága fölé kell helyezni legénysége életét.

18. irányelv:

Ha egy Csillagflotta-tagot hazaárulással vádolnak, a vádlott kérheti a Föderációs törvények szerinti itélkezést. Amennyiben a vádlottat felmentik, a Csillagflotta Főirányelvnokság a vádlott ellen nem hozhat háráltató döntéseket a későbbiek folyamán.

19. irányelv:

Kivéve, ha vészhelyzet áll fenn, a Csillagflotta tagjai nem szállíthatnak sem anyagot, sem személyeket bolygók, vagy bolygórendszerek között, ha okuk van azt hinni, hogy ezeket támadásra akarják felhasználni. Ez a irányelv vonatkozik a független világokra csakúgy, mint a Föderáció tagjaira.

20. irányelv:

A Csillagflotta Főirányelvnokság tisztjeinek és tagjainak tudomással kell bírniuk arról, hogy bizonyos személyek akaratuk ellenére miket birtokolnak, szállítanak, adnak el a Föderáció határain belül.

21. irányelv:

A Föderáció Tanácsának engedélye nélkül egyetlen Csillagflotta-tag - legyen az tiszt, vagy beosztott - sem ajánlhatja fel szolgálatait egy független világ kormányának.

22. irányelv:

A személyiségi jogok és a szabad véleménynyílvánítás tiszteletben tartása megengedi, hogy a Csillagflotta tagjai bármikor személyesen beszélhetnek a saját kormányzati képviselőjükkel, kivéve ha az sérti a szolgálati utat, ezen irányelvok valamelyikét, vagy a Csillagflotta szabályzatát.

23. irányelv:

Amennyiben bizonyítást nyer, hogy egy Csillagflotta-hajó, vagy Föderációs bázis egy tisztje megsérti, vagy megsértette az Elsődleges Irányelvet, azt a tisztet a Föderáció jelen lévő képviselője azonnal fel kell mentse a szolgálat alól és minden erejével vizsgálatot kell elrendelnie az ügyben.

24. irányelv:

Ha egy irányelvnokló tiszt úgy ítéli meg, hogy egy személy, vagy azok csoportja fenyegeti a Csillagflotta tagjait, vagy a Föderáció polgárait, minden igénybe vehető (ha kell, akár erővel is) eszközzel meg kell védje a fenyegetett személyt, vagy személyeket.

25. irányelv:

A civil és katonai személyeket, egy esetleges vészhelyzet esetén, a Csillagflotta tagjai kötelesek megfigyelés alatt tartani, azokat megfelelő rangjuk és beosztásuk szerint elhelyezni, egészen addig, míg ez nem ütközik a Föderáció, vagy a Csillagflotta biztonságával.

26. irányelv:

Egyetlen csillaghajón, vagy földi telepítésű bázison szolgálatot teljesítő személy sem vonható felelősségre a felettese(i) által elkövetett tettekért. Ugyanúgy nem vonható felelősségre az a személy sem, aki közvetlenül nem vett részt a irányelvnokló tiszt(ek) elleni tettekben. Ugyanez vonatkozik az Elsődleges Irányelv megsértésére is, ha az adott beavatkozásra bizonyíték van.

27. irányelv:

A Csillagflotta egyetlen tagjának sem kell szolgálati idejét családjától távol töltenie, ha családja az adott hajón, vagy más Csillagflotta helyőrségen található.

28. irányelv:

Egyetlen irányelvnokló tiszt sem függeszthető fel a szolgálatból, kivéve legalább három vezető beosztású tiszt egybehangzó véleménye alapján. Amennyiben lehetséges, ezen tisztek között kell szerepeljen az első tiszt, a főorvos, a hajó tanácsadója és még egy tiszti beosztású személy.

29. irányelv:

Minden Csillagflotta-hajó és helyőrség irányelvnokának elsődleges felelőssége a legénységének - beleértve a civil személyeket is - jóléte és biztonsága. Egyetlen tett sem jelenthet fenyegetést ezekre a személyekre, kivéve a szolgálatot és ha mindenképpen elkerülhetetlen.

30. irányelv:

A Csillagflotta Főirányelvnokság egyetért abban, hogy minden hajó irányelvnoka úgy értelmezze az Elsődleges Irányelvet, ahogy az adott helyzet megköveteli, a többi paranccsal egyetértésben, és az újonnan felfedezett fajjal kapcsolatban megjelenő körülményekkel összhangban.

31. irányelv:

Az Elsődleges Irányelv feltételeit és részleteit minden újonnan felfedezett létformára alkalmazni kell, legyen az természetes, vagy mesterséges eredetű.

32. irányelv:

Egyetlen Csillagflotta-irányelvnok sincs felhatalmazva arra, hogy a Csillagflotta külön engedélye, vagy vészhelyzet kivételével hajójával warp 5-nél nagyobb sebességgel utazzon.

Omega Direktíva

2269-ben a Lantauro szektorban 127 föderációs tudós Professzor K'Mtu Ketoract vezetésével egy szigorúan titkos kísérleten dolgozott, amelyet Omega-tervnek neveztek. A cél egy kifogyhatatlan energiaforrás létrehozása volt, amely véget vetne az összes többi energiaforrás használatának, innen az Omega név. A kísérletek során egyetlen Omega részecskében annyi energia volt, mint egy térhajtómű reaktorában. Ketoract és számos kozmológus szerint néhány Omega molekula a természetben is létezett egy rövid ideig az Ősrobbanás után. Ketoract szerint az Omega volt a robbanás fő energiaforrása. A tudósok sikeresen létrehoztak egy Omega molekulát, de az a másodperc tört része alatt destabilizálódott, és elpusztította az egész állomást a 127 tudóssal együtt. Váratlan másodlagos hatásként 3.2 fényéves körzetben a szubtéren szakadás következett be. A Csillagflotta vezetése felismerte, hogy nagyobb mennyiségű Omega molekula az egész Kvadránsban elpusztíthatja a szubteret, lehetetlenné téve a nagyobb távolságú utazásokat. Ezért a Csillagflotta titkosított minden adatot a kísérletről, és a hatásáról és azt híresztelte, hogy a Lantauro-szektorbeli szubtérszakadás természetes képződmény. 2270-ben a Csillagflotta létrehozta az Omega Direktívát, miszerint minden fellelt Omega molekulát meg kell semmisíteni, mert féltek attól, hogy ez a hatalmas erő rossz kezekbe kerülhet.